Katja Ott studierte Germanistik, Theater- Film- und Fernsehwissenschaften in Frankfurt am Main.

Sie inszenierte unter anderem an den Kammerspielen München, den Vereinigten Bühnen Krefeld Mönchengladbach und am Staatstheater Braunschweig. Dort war sie von 2004 bis 2009 persönliche Referentin des Generalintendanten und zunächst Leiterin des Kinder- und Jugendtheaters und von 2007-2009 Schauspieldirektorin.

Seit der Spielzeit 2009.10 ist sie Intendantin des Theaters Erlangen.