Katja Ott war nach dem Studium der Germanistik und Theater-, Film- und Fernsehwissenschaft in Frankfurt a. M. als Regieassistentin am Staatstheater Braunschweig und anschließend an den Münchner Kammerspielen engagiert. Als freischaffende Regisseurin arbeitete sie fortan u. a. in Oldenburg, Krefeld-Mönchengladbach, München, Göttingen, Ulm, Braunschweig.
Von 2004 bis 2009 ging sie fest ans Staatstheater Braunschweig als persönliche Referentin des Generalintendanten, künstlerische Leiterin des Jungen Staatstheaters und ab 2007 als Schauspieldirektorin. Seit der Spielzeit 2009/10 ist sie Intendantin am Theater Erlangen.
Inszenierungen am Haus ab 2015:
2015/16Nathan der Weise von Gotthold Ephraim Lessing
2016/17Angst essen Seele auf nach dem Drehbuch von Rainer Werner Fassbinder
2017/18All das Schöne von Duncan Macmillanparadies spielen (abendland. ein abgesang) von Thomas Köck
2018/19Der zerbrochne Krug von Heinrich von Kleist
2019/20Let Them Eat Money. Welche Zukunft?! von Andres Veiel
2020/21So oder so – Hildegard Knef von Gilla Cremer
2021/22Glückliche Tage von Samuel Beckett
2022/23Mein Vater und seine Schatten von Martin Heckmanns
Etwas Besseres als den Tod finden wir überall von Martin Heckmanns
2023/24Die Möwe von Anton Tschechow